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Self-organization, Natural Selection, and Evolution: Cellular Hardware and Genetic Software

Self-organization, Natural Selection, and Evolution: Cellular Hardware and Genetic Software (pdf)

Brian R. Johnson and Sheung Kwan Lam

BioScience December 2010 / Vol. 60 No. 11, 879–885 doi:10.1525/bio.2010.60.11.4

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mémétique – notes #4

Je suis biologiste et j’ai une nette tendance à ranger tout ce qui relève du vivant dans l’ensemble biologie, sans prétendre que ça fait de moi quelqu’un de compétent pour en discuter à fond pour autant, conscient que je suis de la diversité du domaine. Ceci, combiné avec le fait que ça fait longtemps que j’ai abandonné l’anthropocentrisme aussi bien en ce qui concerne le discours scientifique que mes positionnements philosophiques, fait que je vois les sciences humaines comme un sous-ensemble de la biologie, que je rangerais volontiers sous la rubrique éthologie. Et pour ne pas vexer de façon spécifique, j’ajoute que je pense la biologie comme un sous-ensemble de la physique au sens premier du terme.

Ceci étant mis à plat, je reviens vers les mèmes. Des ensembles d’information donc (par définition), qui correspondent à une fonction (restriction que j’impose pour limiter ma réflexion à un type de mèmes identifiables relativement aisément), qui peuvent changer (évoluer) et s’adapter à divers environnements en conservant leur fonction, qui rentrent en compétition pour l’occupation du terrain.

Par définition également, la réplication/propagation des mèmes se fait par imitation et mème en tire son nom.

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mémétique – notes #2

La notion de variants/allèles d’un mème que j’ai évoqué dans la note précédente, en prenant comme exemple la troisième loi de Newton, a deux corollaires qui sont particulièrement intéressants :

  • Les mèmes changent (évoluent) en conservant leur fonction,
  • les allèles d’un mème sont plus ou moins adaptés à leur environnement tout en conservant leur fonction.
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    The evolution of gnathostome development: Insight from chondrichthyan embryology

    The evolution of gnathostome development: Insight from chondrichthyan embryology.

    Gillis JA, Shubin NH

    Genesis, doi: 10.1002/dvg.20567

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    hors sujet

    voilà, que chacun se fasse son opinion, de quel côté est la haine?
    Rédigé par : vincent fleury

    Le commentaire n’est pas vraiment pertinent vis-à-vis du sujet ou de la discussion du blogpost, ni du trackback, qui l’a suscité.

    J’aurais laissé passer volontiers s’il n’était devenu l’amorce d’une discussion avec une jeune fille qui dans certaines uchronies aurait été ma fille ou ma filleule1. Nous avons pris l’habitude avec Elsa, 17 ans bientôt, de papoter via Skype de choses et d’autres et depuis quelques mois, qu’elle suit les blogs scientifiques, les problèmes "science & société", incluant "science & religion", sont abordés.

    Hier soir le commentaire cité ci-dessus a été d’emblée évoqué : "quelle haine ?"

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    Tri-phasic expression of posterior Hox genes during development of pectoral fins in zebrafish: Implications for the evolution of vertebrate paired appendages

    Tri-phasic expression of posterior Hox genes during development of pectoral fins in zebrafish: Implications for the evolution of vertebrate paired appendages

    Ahn D, Ho RK

    Dev Biol (2008 ) Article in press

    "D’un coup d’un seul" hein ?

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    l’évolution "en classe"

    Hier je signalais le papier "darwinian evolution on chip". C’est vrai que ce petit jouet pourra être un instrument éducatif pour les étudiants (peut-être un jour pour les élèves).

    C’est sous cet angle que ScienceDaily le présente :

    Evolution has taken another step away from being dismissed as "a theory" in the classroom, thanks to a new article in PLoS Biology. The research article, by Brian Paegel and Gerald Joyce of The Scripps Research Institute, California, documents the automation of evolution: they have produced a computer-controlled system that can drive the evolution of improved RNA enzymes–biological catalysts–without human input. In the future, this "evolution-machine" could feature in the classroom as well as the lab, allowing students to watch evolution happen in their biology lessons.

    Maintenant, j’en suis à me demander si Charles Harper de la John Templeton Foundation paiera un tel appareil à son ami Jean Staune pour que ce dernier puisse enfin réaliser des travaux pratiques qui lui donneront quelques notions de biologie de l’évolution. Ca lui permettra d’aborder les discussions sur le sujet plus correctement que des estimations sur la base de modèles mathématiques inadéquats.

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    Deriving structure from evolution: metazoan segmentation

    Deriving structure from evolution: metazoan segmentation

    Paul François, Vincent Hakim and Eric D Siggia

    Molecular Systems Biology 18 December 2007; doi:10.1038/msb4100192

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