Archives de la catégorie DIYbio

DIYbio à la Gaîté Lyrique, le 3.11.11

Le Do-it-Yourself Biology (DIYbio)
Le 3 novembre à 19h à la Gaîté Lyrique de Paris. Entrée Libre – Conférence en anglais.

Le laboratoire citoyen pour les biotechnologies « La Paillasse » invite Jason Bobe, directeur du Personal Genome Project et fondateur du DIYbio, pour initier son cycle de conférence.

Jason Bobe est l’Exécutive Director de PersonalGenomes.org et le Director of Community pour le Personal Genome Project (Projet de Génomique Personnelle) basé au laboratoire de George Church à la Harvard Medical School. Le Personal Genome Project cherche à encourager le développement réfléchi de technologies et d’applications de la génomique personnelle en construisant des structures qui permettront leur prototypage et leur évaluation à des échelles toujours grandissantes.

Jason Bobe est aussi le co-fondateur de DIYbio.org, une organisation qui vise à aider à rendre la biologie une poursuite utile pour les citoyens scientifiques et les biologistes amateurs. DIYbio est devenu rapidement le point de référence pour les biologistes amateurs dans le monde entier, unissant les participants du mouvement à travers son site web, ses forums en ligne, son blog et ses groupes régionaux comme l’association La Paillasse en France.

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DIYgenomics

Dans la série des DIYbio, je voudrais DIYgenomics…

DNACowBoy m’en parlait la semaine dernière, et aujourd’hui le twitter de DIYgenomics a accroché le mien. Bien entendu j’ai cliqué moi aussi sur Follow. J’aurais fait plus tôt si je m’étais rendu compte qu’ils avaient un compte. Non pas que ce n’est pas sur la première page de leur site, mais je m’étais précipité pour faire un tour du contenu.

DIYgenomics … making personal genomic information useful

OK, je leur en veut un petit peu d’avoir commencé par l’app Android, mais un peu, celle pour l’iPhone est en développement. ;-)

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A Rapid and Economic In-House DNA Purification Method Using Glass Syringe Filters

A Rapid and Economic In-House DNA Purification Method Using Glass Syringe Filters

Kim Y-C, Morrison SL

PLoS ONE 4(11): e7750. doi:10.1371/journal.pone.0007750

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#DIYbio – 2d

Je reviens brièvement sur le parallèle biologie-informatique et l’intérêt qu’il présente non pas pour le philosophe des sciences mais pour la pratiquant de la biologie, qu’il s’agisse d’un pro ou d’un amateur. Le message étant essentiellement destiné aux amateurs d’ailleurs, les pros ayant fait leur chemin déjà.

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#DIYbio – 2c

Tom reprend de chez Xochipilli une boutade de Jacob Israelachvili (je reprends ici à propos tout le paragraphe) :

Cette approche purement mécanique des formes naturelles a quelque chose de fascinant. Expliquer la beauté du vivant par la seule puissance des lois de la physique est d’autant plus élégant qu’on a un peu tendance à se contenter de l’argument -trop facile- de la sélection naturelle. Comme le dit le physicien israëlien Jacob Israelachvili pour taquiner ses collègues biologistes: « si vous demandez à un physicien pourquoi les pommes tombent par terre, il vous répondra que c’est à cause de la force de gravité. Si vous demandez à un biologiste, il vous expliquera qu’elles n’avaient a priori aucune raison de le faire, mais que seules qui tombaient comme ça ont survécu« .

Je ne sais pas quelle est la source de cette citation, et quand je l’ai lue pour la première fois au Webinet elle m’a fait rigoler plein pot. Jacob Israelachvili sait être un rigolo plein pot mais hors contexte je n’irais pas juger de la pertinence ou non de sa boutade.

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#DIYbio – 2b

Un des commentateurs chez Tom, signant vf, initiales mystérieuses que l’on ne peut essayer d’identifier sans risquer le caca nerveux [addendum heh! qu'est-ce que je disais ?], fait une remarque très intéressante :

Par conséquent, il me semble que l’analogie informatique/biologie n’a aucun sens. La raison profonde de ce “wishful thinking”, à mon avis, c’est que l’informatique, ça marche, on la domine et on en fait ce qu’on veut. On aimerait bien que tout marche aussi bien, soit aussi simple.

Pas d’analogie informatique/biologie, je suis presque d’accord avec lui; il ne s’agit pas d’analogie mais d’identité, là il ne sera pas d’accord avec moi, mais il ne reste pas moins factuel que les systèmes biologiques sont des systèmes capables de traitement d’information reçue de l’extérieur ou générée in situ.

Est-ce qu’il y a des raisons de soupçonner les biologistes de wishful thinking ?

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#DIYbio – 2a

Dans « Biohackers ? Je préfère Biopunks » j’ai juste noté quelques points que Tom traitait dans son billet et ses commentaires. Je reviens vers la discussion qui s’est tenue dans les commentaires et à la quelle j’évite de participer directement (pour des raisons connues des vieux du blog).

Il y a un point qu’il est simple à comprendre, même pour des non-biologistes, qui nous vient du mariage des travaux de Mendel et de la génétique moléculaire qui a permit le lien entre le concept du gène et de son support physique, sous forme d’acides nucléiques, ADN (le plus souvent) et ARN, ce qui caractérise de façon très basique les organismes vivants : ils sont porteurs d’un replicateur qui contient l’information qui les définit. Commencez à tergiverser au sujet de cette notion simple et vous rentrez de plein pied dans le négationnisme scientifique anti-Mendel :-)

Un des piliers de la biologie moderne et comment jouer au St Thomas dans votre garage.

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