Archive pour octobre 2010

Combination of intracortically administered VEGF and environmental enrichment enhances brain protection in developing rats

Combination of intracortically administered VEGF and environmental enrichment enhances brain protection in developing rats

Naiara Ortuzar, Enrike G. Argandon ̃a, Harkaitz Bengoetxea, Jose ́ V. Lafuente

J Neural Transm doi: 10.1007/s00702-010-0496-2

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ask the barmaid

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portable genomics – San Diego

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Portable Genomics opens in San Diego

Portable Genomics, a software developer of comprehensive visualization of personal genomic data, officially opened its doors in La Jolla on Oct. 1. After exploring several possible locations across the U.S., the company’s founders, a French group of molecular biologists from Bordeaux, France, believe La Jolla to be right location for the company due to concentration of local research institutes and genomic medicine industries on the Torrey Mesa. “With San Diego’s extensive involvement in the wireless and medical field, I could not help but move Portable Genomics here,” said CEO Patrick Merel. “CONNECT, CONNECT’s Springboard program and CommNexus’ EvoNexus were of great help in getting Portable Genomics established so we can help advance the industry into electronic health paths.” Portable Genomics is designing a standard interface for comprehensive genome data visualization on mobile platforms and aims to connect genome data with healthcare, pharma, nutrition and wellness providers.

Sometimes, emigration is the solution to a problem. The way France, and Europe in a more wide perspective, deals with personal genomics is the kind of problems that can make it mandatory to seek for more friendly skies. I’m delighted from Patrick’s decision to move his project to the USA. Whatever the future will be for Portable Genomics seeding it at San Diego is a courageous decision. And I very much like people of Patrick’s kind. Did I told you he is my friend? ;-)

Via CONNECT

Disclaimer: part of

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Non-Synonymous and Synonymous Coding SNPs Show Similar Likelihood and Effect Size of Human Disease Association

Non-Synonymous and Synonymous Coding SNPs Show Similar Likelihood and Effect Size of Human Disease Association

Chen R, Davydov EV, Sirota M, Butte AJ

PLoS ONE 5(10): e13574. doi:10.1371/journal.pone.0013574

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a-t-on le droit de fabriquer le vivant ?

J’ai suivi la discussion/débat, juste une petite partie tronquée au début.

D’abord un petit mot au sujet du chat associé à la diffusion. Le modérateur a voulu limiter l’usage aux questions posées aux intervenants. J’ai respecté sa consigne. Néanmoins je la trouve absolument nulle. Je peux comprendre qu’il ne puisse pas suivre deux tableaux à la fois, mais ce n’est peut-être pas le cas de tout le monde. Il devrait se contenter de donner une adresse e-mail où adresser les questions la prochaine fois.

C’est la première fois que je vois Marlière en live. J’aime mieux qu’en écrit. Il a un ton que j’aime bien. Je ne le suivrais pas dans la voie des comités exécutifs, je trouve qu’on en a assez des flics ou des gendarmes incapables de protéger les champs et d’une justice mollassonne qui fait plus de politique que de l’application des lois (je pense fortement aux arracheurs).

Et je ne comprends pas son hargne contre le transhumanisme. Je n’en suis pas grand fan mais je ne vois pas pourquoi je me positionnerais contre. Ca mérite réflexion et peut-être discussion.

Je suis beaucoup moins préoccupé par les risques virtuels de la biologie synthétique que par les risques de la biologie et j’espère que j’en resterai là. Je trouve certes séduisante une biologie synthétique incapable d’interagir avec la biosphère non synthétique, mais je ne suis pas sûr de la nécessité d’un tel genre d’efforts. Je les appuierai de façon inconditionnelle juste pour le fun, c’est le bio-punk suprême à mes yeux.

Fréderic Dardel a été agréable. Peut-être un peu trop agréable. Une voix raisonnable et mesurée mais lui manque le zeste de provocation de Marlière.

Didier Sicard reste un mystère. Un jeu de mains ample mais pas plus. ‘est avis qu’il a oublié de nos dévoiler ses fondamentaux.

Bernadette Bensaude-Vincent est intéressante. Elle donne une nette impression de maîtrise du sujet, puis non… On a l’impression que de façon posée, son raisonnement va aboutir à quelque chose de concret jusqu’à ce q’il fasse plop et nous laisse au point de départ. A nous demander si elle a vraiment réfléchi à ce qu’elle vient de mettre sur la table. Sa prestation sur les risques, quasi magistrale. Il y en aurai trois genres : les bio-erreurs, genre oops, les bio-terreurs, genre tiens prends ça à travers la gueulle, les bio-hackers, genre allez savoir quoi. Quel bio-terroriste irait s’emmerder à faire de la biologie synthétique, ça c’est un point que personne n’a su m’expliquer. Tellement plus simple de faire de la biologie tout court si on veut se lancer dans le terrorisme. Faut ne pas être biologiste pour penser que la biologie synthétique pourrait servir à ça.

Et puis, les bio-hackers, ça fait tellleeement romantique !

Elle est intéressante, mais aussi dangereuse parce qu’il y en a qui pourraient penser qu’elle a fait le tour de la question et que son avis devrait compter. Au sujet du bio-quelque chose je pense qu’elle a une vue plutôt partielle.

La vidéo sera en ligne sur le site qui l’a diffusée à partir de mardi prochain, le 2 novembre donc. Je la passerai une deuxième fois pour la commenter par ici.

4 Commentaires

ΟΧΙ (ρε μάπα…)

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Quantitative dynamic footprinting microscopy reveals mechanisms of neutrophil rolling

Quantitative dynamic footprinting microscopy reveals mechanisms of neutrophil rolling

Prithu Sundd, Edgar Gutierrez, Maria K Pospieszalska, Hong Zhang, Alexander Groisman & Klaus Ley

Nature Methods 7 , 821–824 (2010) doi:10.1038/nmeth.1508

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Chemical synthesis of the mouse mitochondrial genome

Chemical synthesis of the mouse mitochondrial genome

Daniel G Gibson, Hamilton O Smith, Clyde A Hutchison III, J Craig Venter & Chuck Merryman

Nature Methods Published online: 10 October 2010 | doi:10.1038/nmeth.1515

We describe a one-step, isothermal assembly method for synthesizing DNA molecules from overlapping oligonucleotides. The method cycles between in vitro recombination and amplification until the desired length is reached. As a demonstration of its simplicity and robustness, we synthesized the entire 16.3-kilobase mouse mitochondrial genome from 600 overlapping 60-mers.

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ME: IN FOCUS

October 2010: The Special Breast Cancer Awareness Issue

Via @portablegenomic

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Notch3 Is Critical for Proper Angiogenesis and Mural Cell Investment

Notch3 Is Critical for Proper Angiogenesis and Mural Cell Investment

Hua Liu, Wenbo Zhang, Simone Kennard, Ruth B. Caldwell and Brenda Lilly

Circ. Res. 2010;107;860-870; originally published online Aug 5, 2010; doi: 10.1161/CIRCRESAHA.110.218271

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