Archive pour décembre 2009

The Inflammasomes

The Inflammasomes

Mohamed Lamkanfi, Vishva M. Dixit

PLoS Pathog 5(12): e1000510. doi:10.1371/journal.ppat.1000510

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Bacterial Effector Binding to Ribosomal Protein S3 Subverts NF-κB Function

Bacterial Effector Binding to Ribosomal Protein S3 Subverts NF-κB Function

Xiaofei Gao, Fengyi Wan, Kristina Mateo, Eduardo Callegari, Dan Wang, Wanyin Deng, Jose Puente, Feng Li, Michael S. Chaussee, B. Brett Finlay, Michael J. Lenardo, Philip R. Hardwidge

PLoS Pathog 5(12): e1000708. doi:10.1371/journal.ppat.1000708

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The Photobiology of Microbial Pathogenesis

The Photobiology of Microbial Pathogenesis

Alexander Idnurm, Sean Crosson

PLoS Pathog 5(11): e1000470. doi:10.1371/journal.ppat.1000470

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The Presence of VEGF Receptors on the Luminal Surface of Endothelial Cells Affects VEGF Distribution and VEGF Signaling

The Presence of VEGF Receptors on the Luminal Surface of Endothelial Cells Affects VEGF Distribution and VEGF Signaling

Marianne O. Stefanini, Florence T. H. Wu, Feilim Mac Gabhann, Aleksander S. Popel

PLoS Comput Biol 5(12): e1000622. doi:10.1371/journal.pcbi.1000622

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Introduction to the Quantitative Analysis of Two-Dimensional Fluorescence Microscopy Images for Cell-Based Screening

Introduction to the Quantitative Analysis of Two-Dimensional Fluorescence Microscopy Images for Cell-Based Screening.

Ljosa V, Carpenter AE (2009)

PLoS Comput Biol 5(12): e1000603. doi:10.1371/journal.pcbi.1000603

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A Quick Guide for Developing Effective Bioinformatics Programming Skills

A Quick Guide for Developing Effective Bioinformatics Programming Skills.

Dudley JT, Butte AJ (2009)

PLoS Comput Biol 5(12): e1000589. doi:10.1371/journal.pcbi.1000589

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Eating Termites

Dans la suite des machins qui permettent à des primates de manger des termites le piège-nocturne-lampe-à-pétrole-dans-la-bassine pour ramasser les termites volants à la bonne période !

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mémétique – notes #4

Je suis biologiste et j’ai une nette tendance à ranger tout ce qui relève du vivant dans l’ensemble biologie, sans prétendre que ça fait de moi quelqu’un de compétent pour en discuter à fond pour autant, conscient que je suis de la diversité du domaine. Ceci, combiné avec le fait que ça fait longtemps que j’ai abandonné l’anthropocentrisme aussi bien en ce qui concerne le discours scientifique que mes positionnements philosophiques, fait que je vois les sciences humaines comme un sous-ensemble de la biologie, que je rangerais volontiers sous la rubrique éthologie. Et pour ne pas vexer de façon spécifique, j’ajoute que je pense la biologie comme un sous-ensemble de la physique au sens premier du terme.

Ceci étant mis à plat, je reviens vers les mèmes. Des ensembles d’information donc (par définition), qui correspondent à une fonction (restriction que j’impose pour limiter ma réflexion à un type de mèmes identifiables relativement aisément), qui peuvent changer (évoluer) et s’adapter à divers environnements en conservant leur fonction, qui rentrent en compétition pour l’occupation du terrain.

Par définition également, la réplication/propagation des mèmes se fait par imitation et mème en tire son nom.

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mémétique – notes #3

Действию всегда есть равное и противоположное противодействие, иначе, взаимодействия двух тел друг на друга между собой равны и направлены в противоположные стороны.

N’est-ce pas ? Si vous comprenez le russe vous avez probablement identifié la troisième loi de Newton, surtout après avoir lu les deux posts précédents. Sachant que je ne comprends pas un pet de russe et que ça m’a pris quelques secondes pour identifier cet allèle qui a première vue pour moi ne présente pas d’homologie, sens, ou quoi que ce soit pour me guider à identifier la fonction, je devrais mettre un peu d’eau dans mon vin quant à l’identification d’un mème uniquement à partir du moment que l’on peut lui attribuer une fonction.

En fait l’identification a été positionnelle !

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mémétique – notes #2

La notion de variants/allèles d’un mème que j’ai évoqué dans la note précédente, en prenant comme exemple la troisième loi de Newton, a deux corollaires qui sont particulièrement intéressants :

  • Les mèmes changent (évoluent) en conservant leur fonction,
  • les allèles d’un mème sont plus ou moins adaptés à leur environnement tout en conservant leur fonction.
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