blogo-links

You said one thing wrong, therefore everything you ever said is also wrong
Et dire que l’on a l’exemple de mecs qui sont des détecteurs de non sens…

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Axis of evil: Discovery Institute + Harun Yahya
Sans blague ! Ressemble à JTF & UIP IMO

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Sympathy

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Autocensure ! Viens de virer un lien pour lequel je voulais être négativement critique. On ne peut pas courir derrière toutes les inepties à la fois.

Say Amen!

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Randi Testing Reindeer Aerodynamics
Raining reindeers !

un mystère de résolu

J’ai une idée lumineuse ce matin en pensant à cette histoire de thymidylate synthase : d’habitude Jean Staune ne sais pas de quoi il parle !

OK, elle n’est pas si lumineuse que ça mon idée, je sais déjà que Jean ne sait pas de quoi il parle (surtout en biolo). Donc j’ai refait ma recherche de thymidylate synthase, mais cette fois en ayant décoché la limitation aux mammifères. Et hop !

ThyX a fait son apparition sur mon écran. Il y a bel et bien deux thymidylate synthases, qui sont deux enzymes complètement différentes et qui sont les catalyseurs de deux réactions différentes¹ partageant un produit final commun, le dTMP. La ThyX n’est connue que dans un seul eucaryote^{1 et figure liée} ni le rat, ni la souris. L’invité de l’UIP aurait-il fait une découverte qu’il a oublié de consigné dans les bases de données ? Peut-être, peut-être pas. Peut-être pas est plus probable.

Je laisse le bénéfice du doute à J-F Moreel et la responsabilité du contenu du TNBI à son auteur, le Jean Staune. Salut Jean encore et encore du non-sens… t’en as pas ras le cul de raconter n’importe quoi ?

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1 Folate-Dependent Thymidylate-Forming Enzymes: Parallels between DNA and RNA Metabolic Enzymes and Evolutionary Implications, Hannu Myllykallio, Stephane Skouloubris, Henri Grosjean, and Ursula LieblDNA and RNA Modification Enzymes: Structure, Mechanism, Function and Evolution, edited by Henri Grosjean. 2009 Landes Bioscience

Roles of ES Cell-Derived Gliogenic Neural Stem/Progenitor Cells in Functional Recovery after Spinal Cord Injury

Roles of ES Cell-Derived Gliogenic Neural Stem/Progenitor Cells in Functional Recovery after Spinal Cord Injury.

Gentaro Kumagai, Yohei Okada, Junichi Yamane, Narihito Nagoshi, Kazuya Kitamura, Masahiko Mukaino, Osahiko Tsuji, Kanehiro Fujiyoshi, Hiroyuki Katoh, Seiji Okada, Shinsuke Shibata, Yumi Matsuzaki, Satoshi Toh, Yoshiaki Toyama, Masaya Nakamura, Hideyuki Okano

PLoS ONE 4(11): e7706. doi:10.1371/journal.pone.0007706

commentaire de Jude : Gravitation

Salut,

Rien à voir avec quelque blague sur quelque chute de pomme, mais ci-joint un scan illustrant le pluralisme interprétatif auquel peut donner la notion de gravitation, sans même parler du point de vue relativiste. Feynman poursuit plus loin en disant que ce sont souvent les interprétations qui paraissent les plus absurdes au niveau du bon sens philosophique (et pas forcément les plus simples) qui permettent le plus de faire avancer la science (imaginer que les possibles sont simultanément effectifs, faire sauter la causalité, se joeur du temps, etc.).

Remarque : la notion même de force ne peut pas être tranchée “ontologiquement” ! En effet, on observe des invariants réguliers au niveau de la variation première de la variation première de position multipliée par la masse, et les classes de ces invariants sont au final appelées forces (le principe fondamental de la dynamique se mord la queue, il exprime juste ce à quoi on s’intéresse en terme de régularité dans les phénomènes/changements). Après, l’expression relationnelle, c’est à dire le formalisme mathématique, admet plusieurs formes totalement équivalentes : mais philosophiquement non puisque l’une fait appel à une force à distance, l’autre à une géométrie sur un champ, encore une autre à un phénomène de propagation (si! si!), une autre encore à un “choix” (le terme n’est pas bien choisi) au niveau particules, etc.

Ce que je veux dire, c’est que le pluralisme interprétatif “non tranchable” apparaît très tôt. Même si c’est un petit peu plus subtil que cela …un débat de ce genre m’apparaîtrait plus pertinent qu’une blague foireuse !

Quid des “téléo” lorsque l’on pense qu’il peut y’avoir plusieurs interprétations, par exemple avec ou sans variantes des tatwd ? On prend par défaut le nom qui correspond à l’hypothèse minimale ou aux tendances fantaisistes de l’auteur ?

clic pour une version plus lisible.

Agora

Quelque chose me dit que je devrais aller au ciné :

Amenabar se pare d’un budget de blockbuster hollywoodien pour réfléchir sur les dérives religieuses contemporaines. Moins un péplum qu’un pensum théologique, le résultat est aussi surprenant que passionnant et confirme l’incroyable maturité d’Alejandro Amenabar et de son co-scénariste Mateo Gil. Plus que jamais deux auteurs à suivre…

via à voir|lire

par exemple

la souris possède la forme A, alors que le rat possède la forme X.

Update 9.11.09 12:56: j’ai les deux thyA et thyX, des enzymes vraiment différents Je me garde ça pour la soirée.

En fait la question bizarre qui a suscité le post sur les thymidylate synthases, est due à Jean Staune et une des histoires qu’il raconte dans le TNBI.

Il semblerait qu’il y a deux formes de thymidylate synthase (je n’en ai trouvé qu’une seule, l’autre est apocryphe ou elle a un autre nom).

Le fait est que rat, souris et homme partagent la même thymidylate synthase et elles sont suffisamment homologues pour que les délires statistiques de Jean s’apparentent à ceux de John Joe McFadden.

Là où ça se corse est qu’il y a pire ! la triptophane [sic] ! Aha ! Là il nous a eu Jean. La tri•pro•pha•ne ! La triptophane qui effectue elle aussi une synthèse importante…
On peut supposer qu’il s’agit de la tryptophane synthase qui existerait sous deux formes A et B. L’enzyme est en fait un tétramère α₂β₂, les chaînes α convertissant l’indole 3-glycérophosphate en indole et glycéraldéhyde 3-phosphate à la suite de quoi les sous-unités β condensent l’indole à une sérine pour produire du tryptophane. Le tetramère est un catalyseur bien plus efficace que les chaînes séparées.

J’espère que l’invité de JS à l’UIP n’a pas confondu les deux types de chaînes pour deux enzymes catalysant la même réaction…

Enfin, ça restera un deux mystères. SVP, tant qu’à m’envoyer des photos du TNBI pour me convaincre que vous ne souffrez pas d’hallucinations, ou pour poser une question, envoyez moi des scans de bonne qualité; je finirai par avoir une version électronique du TNBI

On the Origin of Religion

NewsFocus signé par Elisabeth Culotta dans le dernier numéro de Science.

To Charles Darwin, the origin of religious belief was no mystery. “As soon as the important faculties of the imagination, won- der, and curiosity, together with some power of reasoning, had become partially devel- oped, man would naturally crave to under- stand what was passing around him, and would have vaguely speculated on his own existence,” he wrote in The Descent of Man.

Le vrai mystère n’est pas tant comment les religions ont apparu mais comment elles peuvent persister.

Petit moment d’hilarité en lisant au sujet de Vénus de Hohle Fels :

The “Venus of Hohle Fels” illustrates the difficulties of interpreting such ancient objects: Conard, who discovered it, considers the 6-centimeter figure of a headless woman with huge breasts and carefully carved genitalia to be a religious fertility object, while archaeologist Paul Mellars of the University of Cambridge has called it “paleo-porn.”

Je ne vois pas d’incompatibilité entre une déité de la fertilité et le porno, plusieurs déités du genre ayant bénéficié d’esclaves prostituées (pas nécessairement acquises au marché des esclaves) pour que le clergé se remplisse les poches tandis que les fidèles se vidaient les bourses¹.
D’ailleurs encore aujourd’hui les religions s’intéressent beaucoup trop aux questions du sex, précisant comment pratiquer pour éviter le pêcher, qui et quand on a le droit de pratiquer, sans oublier la récompense des martyrs pour l’islam qui sont sensés arriver direct au Paradis pour profiter des vierges qui leur sont réservées !

Sans oublier l’association fréquente entre prêtrise et pédophilie…

1 pas un mot au sujet du phallus de Hohle Fels (voir là et là

thymidylate synthase (?)

Je viens de recevoir une des plus inhabituelles requêtes de blogpost que j’ai eu jusqu’à présent et sur un ton absolument mystérieux. On me demande de comparer les thymidilate synthases du rat et de la souris !

La personne qui me pose la colle ne sait pas se servir des outils de comparaisons de séquences, ne saurait probablement pas où aller les chercher, elle n’a rien à voir avec le sujet !

Mystère et boule de gomme que cet intérêt soudain, qu’elle promet d’éclaircir dès que j’aurais fait le boulot.

Autant pour faire plaisir à une amie que pour savoir de quoi il retourne…

God said, “Let there be coffee.” And it was good, very, very good

Je vous propose de découvrir Coffee Creations, art created using only espresso (ce qui n’est pas le gaspillage qu’on aurait pu soupçonner) et Karen qui est la gaspilleuse.
HT Marilyn Terrell

téléologique, téléonomique, téléomatique

Il n’est pas mauvais de définir quelques termes avant de commencer une discussion sur un sujet qui semble être en équilibre métastable et prêt de partir en vrille. C’est aussi l’occasion pour poser les bases pour dénoncer des pratiques pour le moins douteuses de certains, et des points de vue qui ne sont pas aussi explicitement exposés qu’on pourrait le souhaiter.

Les trois termes que j’ai choisi pour ce post sont tous à base de téléo-, du grec tέλος, fin.