Daniel Dennett: Is Science Showing That We Don’t Have Free Will?

[Youtube http://www.youtube.com/watch?v=5cSgVgrC-6Y]

Explaining the Linguistic Diversity of Sahul Using Population Models

Explaining the Linguistic Diversity of Sahul Using Population Models.
Reesink G, Singer R, Dunn M (2009)
PLoS Biol 7(11): e1000241. doi:10.1371/journal.pbio.1000241

Oktar, Staune

Je pique ces deux paragraphes à PZ Myers, vous lirez le reste du post ici.

And then the creationists have produced a web page that claims to address criticisms of Oktar. For instance, you may recall that in his lavish creationist book, Atlas of Creation, he claims that organisms never change; the bulk of the book consists of plagiarized photos, pairing a picture of a modern organism with a fossil that shows relatively little change. The classic example of his sloppy methodology is that one of the pairs is of caddis flies, and the modern example is this one, an artificial lure, complete with fishhook.

Well, they have an explanation for that now: uh, yeah, they meant to do that. It was a model, yeah, that’s the ticket. They put that picture in the book intentionally, yeah, and they knew they’d catch Richard Dawkins. And then Adnan would get a date with Heather Locklear! Yeah, that’s the ticket!

Ah, ça me rappelle des bons souvenirs, avec Jean Staune coincé en train de se forger des excuses de toutes pièces pour mieux se planter sur le deuxième round ! Le tout à la disposition de ses fans sur le Web.

Lucy In The Sky With Diamonds

Avec une petite pensée pour Sir Arthur C. Clarke (Odyssée 2061)

formes contraintes ?

Avec flocons de neige j’ai abordé un processus téléonomique simple, celui de l’addition de molécules d’eau à un cristal en formation, pour montrer que l’histoire de chaque flocon, même de chaque branche d’un flocon, joue un rôle important dans la structure finale que l’on obtient. Ceci est vrai aussi pour les formes à six branches, qui semblent être les seules qui ont eu l’attention de notre ami Staune.

Il est probable que l’explication aurait été plus élégante si on parlait de brisures de symétries, mais je laisserai le soin aux professionnels calés de vous entretenir de ça.
Après avoir très brièvement évoqué un système très contraint qui ne se prive pas de pouvoir donner un gros, très gros paquet de formes différentes, j’aimerais passer au point de vue de Michael Denton au sujet des formes platoniques.

Retinoic acid signaling targets Hox genes during the amphioxus gastrula stage: insights into early anterior-posterior patterning of the chordate body plan

Retinoic acid signaling targets Hox genes during the amphioxus gastrula stage: insights into early anterior-posterior patterning of the chordate body plan.

Koop D, Holland ND, Sémon M, Alvarez S, Rodriguez de Lera A, Laudet V, Holland LZ, Schubert M.

Developmental Biology Article in Press, Accepted Manuscript doi:10.1016/j.ydbio.2009.11.016

blogo-links

Le jeteur de sable
Chez Med’celine

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Quand le Figaro parle de parapsychologie…
Il y a des commentaires chez Figaro qui sont en or massif

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The Clone Song: You don’t need to
Branlette S-F

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VIDEO – Immune Cell Tracking a Chemical Scent
with holographic optical tweezers

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Bad Faith Awards 2009: the polls are open
Difficile de choisir un seul ! Va pour BXVI.

worth spiting for?

#23andme #personalgenomics #DTC @samiahurst @portablegenomic

The request is from my favorite bioethicist and thus can’t be ignored:

@OldCola Please don’t tell me you think 23andme is worth spiting for. Or else explain, pleeease…I don’t get it

Let’s start with two disclaimers:

I’m a data junkie and expecting great gains from large collections and correlation searches

I’m quite seriously considering to work in a parallel domain, concerning also DTC personal genome services

Trois en un (& bonus)

J’étais en train de réfléchir à une discussion IRL au sujet des SNPs qui est partie d’un commentaire/réponse à Jude (que je n’arrive plus à retrouver, hah! c’était dans un e-mail, le garde pour plus tard [Oct 13, 2009 at 8:45 PM]) où je parlais des effets des mutations silencieuses, a.k.a. synonymes.

Réputées mutations neutres, très discutées dans le cadre de la dérive génétique, je trouve qu’elles sont pas assez étudiées. Il y a diverses façons dont une mutation synonyme (qui n’affecte pas la structure primaire d’une protéine, passant d’un codon à l’autre, les deux codant pour le même aminoacide) peut affecter les fonctions cellulaires liées au produit du gène la portant. L’importance est de taille si les deux allèles déterminent des fitness différentes. Habituellement on ne tient pas compte de ces phénomènes, les allèles sont considérés égaux en termes de fitness et l’apparence va dans le sens de la dérive génétique au dépens de la sélection.

Je me disais que l’idéal ça serait de trouver un cas où une mutation synonyme ne soit pas “neutre” et “silencieuse”.

En même temps j’étais préoccupé par le réductionnisme fondamental tel que présenté par Woese, qui semble importuner aussi Tom et qui a été repris par Staune dans le TNBI.

Et pensant au TNBI, je me disais que le point de vue de Denton, qui ne comprend pas la sélection naturelle, pas plus que Staune, se trouverait aussi mal si une mutation silencieuse (même pas de changement de structure primaire !) affectait la fonction de la protéine résultante.

Il y a des moments où l’on a raison de demander trop. Une recherche biblio sur PubMed plus tard, j’ai trouvé exactement ce que je cherchais : une mutation synonyme pas du tout silencieuse et dont l’effet peut être corrigé par des facteurs environnementaux :

A “silent” polymorphism in the MDR1 gene changes substrate specificity, Kimchi-Sarfaty C, Oh JM, Kim IW, Sauna ZE, Calcagno AM, Ambudkar SV, Gottesman MM, Science. 2007 Jan 26;315(5811):525-8, doi: 10.1126/science.1135308.

Destination Canada 2009 – Forum Emploi

Destination Canada 2009 – Forum Emploi

Paris : mardi 17, mercredi 18 et jeudi 19 novembre 2009

Bruxelles : samedi 21 novembre 2009

C’est le rendez-vous incontournable pour l’expatriation temporaire ou permanente vers le Canada.