Je viens de recevoir une des plus inhabituelles requêtes de blogpost que j’ai eu jusqu’à présent et sur un ton absolument mystérieux. On me demande de comparer les thymidilate synthases du rat et de la souris !
La personne qui me pose la colle ne sait pas se servir des outils de comparaisons de séquences, ne saurait probablement pas où aller les chercher, elle n’a rien à voir avec le sujet !
Mystère et boule de gomme que cet intérêt soudain, qu’elle promet d’éclaircir dès que j’aurais fait le boulot.
Autant pour faire plaisir à une amie que pour savoir de quoi il retourne…
EDL37259.1 thymidylate synthase, isoform CRA_a [Mus musculus]
EDL90969.1 thymidylate synthase [Rattus norvegicus]
EAX01716.1 thymidylate synthetase, isoform CRA_a [Homo sapiens]
EDL37259 1 SLTTLLPDCSVMLVVGSELQSDAQQLSAEA------PRHGELQYLRQVEHILRCGFKKEDRTGTGTLSVFGMQARYSLRD 74 EDL90969 1 -----------MLVEGSELQSGAQQPRTEA------PQHGELQYLRQVEHIMRCGFKKEDRTGTGTLSVFGMQARYSLRD 63 EAX01716 1 -----------MPVAGSELPRRPLPPAAQERDAEPRPPHGELQYLGQIQHILRCGVRKDDRTGTGTLSVFGMQARYSLRD 69 EDL37259 75 EFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKELSSKGVRIWDANGSRDFLDSLGFSARQEGDLGPVYGFQWRHFGAEYKDM 154 EDL90969 64 EFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKELSSKGVRIWDANGSRDFLDSLGFSARQEGDLGPVYGFQWRHFGADYKDM 143 EAX01716 70 EFPLLTTKRVFWKGVLEELLWFIKGSTNAKELSSKGVKIWDANGSRDFLDSLGFSTREEGDLGPVYGFQWRHFGAEYRDM 149 EDL37259 155 DSDYSGQGVDQLQKVIDTIKTNPDDRRIIMCAWNPKDLPLMALPPCHALCQFYVVNGELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIAS 234 EDL90969 144 DSDYSGQGVDQLQKVIDTIKTNPDDRRIIMCAWNPKDLPLMALPPCHALCQFYVVNGELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIAS 223 EAX01716 150 ESD----------------------------------LPLMALPPCHALCQFYVVNSELSCQLYQRSGDMGLGVPFNIAS 195 EDL37259 235 YALLTYMIAHITGLQPGDFVHTLGDAHIYLNHIEPLKIQLQREPRPFPKLKILRKVETIDDFKVEDFQIEGYNPHPTIKM 314 EDL90969 224 YALLTYMIAHITGLQPGDFVHTLGDAHIYLNHIEPLKIQLQREPRPFPKLRILRKVETIDDFKVEDFQIEGYNPHPTIKM 303 EAX01716 196 YALLTYMIAHITGLKPGDFIHTLGDAHIYLNHIEPLKIQLQREPRPFPKLRILRKVEKIDDFKAEDFQIEGYNPHPTIKM 275 EDL37259 315 EMAV 318 EDL90969 304 EMAV 307 EAX01716 276 EMAV 279
La comparaison a été faite avec Cobalt et j’ai ajouté l’isoforme a de la TS humaine, juste pour faire beau.
Voilà, heureuse ?
