Blackout

Deux semaines (ou presque) sans Internet : pas d’e-mail, pas de Web, pas de Twitter. Régression pour me reposer, réfléchir à des trucs et d’autres, écrire un peu.

En association étroite avec des vacances près de la Méditerranée, à me chercher des poulpes ou des calamars à cuisiner.

Du 16/09 au 30/09 au moins. Plus si nécessaire (il y a un chouia d’activité professionnelle là dessous).

Je bloque les commentaires ici et ailleurs, je mets en route les répondeurs automatiques, et j’espère que le repos me rendra un peu plus virulent après la rentrée (je trouve que j eme suis ramolli un peu).

Imaging cell signalling and movement in development

Imaging cell signalling and movement in development

Manli Chuai, Dirk Dormann and Cornelis J. Weijer

Seminars in Cell & Developmental Biology Article in Press, Uncorrected Proof doi:10.1016/j.semcdb.2009.09.001

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Le printemps froid, troisième partie

[…] Avant d’entrer dans le vif du sujet, revenons à la notion d’espèce telle qu’elle est le plus couramment admise.[…]

Avec des morceaux de Doolitle

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Dawkins 17, Armstrong 0

Oh Lord, can there be a match more uneven than this? In one corner: Karen Armstrong, embracer of apophatic theology, a wooly-headed apologist who insists that we can say nothing about God but who somehow keeps cranking out book after book on the subject. In the other: Richard Dawkins, the Oxford Mauler, who will have none of that nonsense.

Comment peut-on compter des points dans le néant de Karen Armstrong ? Mystère.

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L’évolution, arnaque dogmatique ou théorie scientifique ?

2009, bicentenaire de la naissance de Darwin, cent cinquantenaire de la publication de “L’origine des espèces”. Les publications se déchaînent et chacun y va de sa conférence ou de son commentaire. Qu’en est-il réellement ? Doit-on craindre le créationnisme? Doit-on remettre en cause la théorie synthétique de l’évolution (ou NéoDarwinisme)? Qu’est-ce que les sciences ont à nous dire ? Comment les organismes évoluent-ils? La culture est-elle l’un des résultats de l’évolution? Ce sont quelques questions parmis tant d’autres*. Le sujet va être tourné et retourné dans tous les sens en 2009. Mais finalement, quel impact pour le citoyen que je suis ?

Où les commentaires valent le detour, grâce à la présence de Michel Julien, un collectionneur de non-sens créationnistes qui mérite d’être connu (aspirine ou assimilé probablement nécessaire.

#DIYbio – 2d

Je reviens brièvement sur le parallèle biologie-informatique et l’intérêt qu’il présente non pas pour le philosophe des sciences mais pour la pratiquant de la biologie, qu’il s’agisse d’un pro ou d’un amateur. Le message étant essentiellement destiné aux amateurs d’ailleurs, les pros ayant fait leur chemin déjà.

Janine Benyus: 12 sustainable design ideas from nature

And

Effects of Coffee Bean Aroma on the Rat Brain Stressed by Sleep Deprivation: A Selected Transcript- and 2D Gel-Based Proteome Analysis

Effects of Coffee Bean Aroma on the Rat Brain Stressed by Sleep Deprivation: A Selected Transcript- and 2D Gel-Based Proteome Analysis

Han-Seok Seo, Misato Hirano, Junko Shibato, Randeep Rakwal, In Kyeong Hwang, Yoshinori Masuo

Journal of Agricultural and Food Chemistry 2008 56 (12), 4665-4673

HT @Fyrefly

#DIYbio sterile hood

DIY sterile hood

Originally uploaded by meneertuur

Je vais commencer un collection peut-être

#DIYbio – 2c

Tom reprend de chez Xochipilli une boutade de Jacob Israelachvili (je reprends ici à propos tout le paragraphe) :

Cette approche purement mécanique des formes naturelles a quelque chose de fascinant. Expliquer la beauté du vivant par la seule puissance des lois de la physique est d’autant plus élégant qu’on a un peu tendance à se contenter de l’argument -trop facile- de la sélection naturelle. Comme le dit le physicien israëlien Jacob Israelachvili pour taquiner ses collègues biologistes: “si vous demandez à un physicien pourquoi les pommes tombent par terre, il vous répondra que c’est à cause de la force de gravité. Si vous demandez à un biologiste, il vous expliquera qu’elles n’avaient a priori aucune raison de le faire, mais que seules qui tombaient comme ça ont survécu“.

Je ne sais pas quelle est la source de cette citation, et quand je l’ai lue pour la première fois au Webinet elle m’a fait rigoler plein pot. Jacob Israelachvili sait être un rigolo plein pot mais hors contexte je n’irais pas juger de la pertinence ou non de sa boutade.

#DIYbio – 2b

Un des commentateurs chez Tom, signant vf, initiales mystérieuses que l’on ne peut essayer d’identifier sans risquer le caca nerveux [addendum heh! qu'est-ce que je disais ?], fait une remarque très intéressante :

Par conséquent, il me semble que l’analogie informatique/biologie n’a aucun sens. La raison profonde de ce “wishful thinking”, à mon avis, c’est que l’informatique, ça marche, on la domine et on en fait ce qu’on veut. On aimerait bien que tout marche aussi bien, soit aussi simple.

Pas d’analogie informatique/biologie, je suis presque d’accord avec lui; il ne s’agit pas d’analogie mais d’identité, là il ne sera pas d’accord avec moi, mais il ne reste pas moins factuel que les systèmes biologiques sont des systèmes capables de traitement d’information reçue de l’extérieur ou générée in situ.

Est-ce qu’il y a des raisons de soupçonner les biologistes de wishful thinking ?

#DIYbio – 2a

Dans “Biohackers ? Je préfère Biopunks” j’ai juste noté quelques points que Tom traitait dans son billet et ses commentaires. Je reviens vers la discussion qui s’est tenue dans les commentaires et à la quelle j’évite de participer directement (pour des raisons connues des vieux du blog).

Il y a un point qu’il est simple à comprendre, même pour des non-biologistes, qui nous vient du mariage des travaux de Mendel et de la génétique moléculaire qui a permit le lien entre le concept du gène et de son support physique, sous forme d’acides nucléiques, ADN (le plus souvent) et ARN, ce qui caractérise de façon très basique les organismes vivants : ils sont porteurs d’un replicateur qui contient l’information qui les définit. Commencez à tergiverser au sujet de cette notion simple et vous rentrez de plein pied dans le négationnisme scientifique anti-Mendel

Un des piliers de la biologie moderne et comment jouer au St Thomas dans votre garage.