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	<title>Commentaires sur : Oxygen modifies artery differentiation and network morphogenesis in the retinal vasculature</title>
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	<description>by Oldcola, notes de lectures en buvant le café</description>
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		<item>
		<title>Par : cadre vertueux des laboratoires &#171; Coffee and Sci(ence)</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-963</link>
		<dc:creator>cadre vertueux des laboratoires &#171; Coffee and Sci(ence)</dc:creator>
		<pubDate>Mon, 04 Aug 2008 15:01:16 +0000</pubDate>
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		<description>[...] est invité à donner par qui souhaite l&#8217;entendre, y compris à l&#8217;UIP. En d&#8217;autres circonstances on s&#8217;attendrait presque à ce que VF m&#8217;adresse un petit mot de sympathie et de soutien [...]</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>[...] est invité à donner par qui souhaite l&#8217;entendre, y compris à l&#8217;UIP. En d&#8217;autres circonstances on s&#8217;attendrait presque à ce que VF m&#8217;adresse un petit mot de sympathie et de soutien [...]</p>
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		<title>Par : Prise de bec, anonyme pour l&#8217;instant &#171; Coffee and Sci(ence)</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-891</link>
		<dc:creator>Prise de bec, anonyme pour l&#8217;instant &#171; Coffee and Sci(ence)</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 17:17:16 +0000</pubDate>
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		<description>[...] Ma motivation en tant que blogger n&#8217;est absolument pas d&#8217;alimenter de sains et vifs débats scientifiques pour faire avancer sa discipline; juste d&#8217;exprimer mon opinion sur des sujets et autres et éventuellement la discuter avec les gens que je choisis, les trolls qui passent leur temps à faire du hors sujet étant simplement éjectés, comme ça a été le cas de Vincent Fleury pas plus tard qu&#8217;aujourd&#8217;hui. [...]</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>[...] Ma motivation en tant que blogger n&#8217;est absolument pas d&#8217;alimenter de sains et vifs débats scientifiques pour faire avancer sa discipline; juste d&#8217;exprimer mon opinion sur des sujets et autres et éventuellement la discuter avec les gens que je choisis, les trolls qui passent leur temps à faire du hors sujet étant simplement éjectés, comme ça a été le cas de Vincent Fleury pas plus tard qu&#8217;aujourd&#8217;hui. [...]</p>
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	</item>
	<item>
		<title>Par : Oldcola</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-890</link>
		<dc:creator>Oldcola</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 11:03:08 +0000</pubDate>
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		<description>? A l&#039;abri sur le Net ? Merde ! 

OK, c&#039;est le dernier commentaire hors sujet qui passe, pour que ce soit clair que vous êtes hors sujet.

J&#039;ai eu la faiblesse de penser que la discussion aurait pu se calmer. Ce n&#039;est pas le cas. 

Je regrette d&#039;avoir laissé passer votre commentaire du &quot;juin 9, 2008 à 4:25&quot; et votre nom passe à nouveau au &quot;spam direct&quot;.

Avec mes compliments.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>? A l&#8217;abri sur le Net ? Merde ! </p>
<p>OK, c&#8217;est le dernier commentaire hors sujet qui passe, pour que ce soit clair que vous êtes hors sujet.</p>
<p>J&#8217;ai eu la faiblesse de penser que la discussion aurait pu se calmer. Ce n&#8217;est pas le cas. </p>
<p>Je regrette d&#8217;avoir laissé passer votre commentaire du &#8220;juin 9, 2008 à 4:25&#8243; et votre nom passe à nouveau au &#8220;spam direct&#8221;.</p>
<p>Avec mes compliments.</p>
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	<item>
		<title>Par : vincent fleury</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-889</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 10:48:23 +0000</pubDate>
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		<description>Evidemment, c&#039;est plus facile de faire ce que vous faites à l&#039;abri dans votre tannière; mais à 11h34 vous êtes où exactement?</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>Evidemment, c&#8217;est plus facile de faire ce que vous faites à l&#8217;abri dans votre tannière; mais à 11h34 vous êtes où exactement?</p>
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		<title>Par : Oldcola</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-888</link>
		<dc:creator>Oldcola</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 10:34:22 +0000</pubDate>
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		<description>Yep, je suis presque d&#039;accord avec vous, pour les idées &lt;i&gt;basiques&lt;/i&gt; ;-)

Tenir mon blog personnel dans un laboratoire universitaire ? Quelle idée saugrenue !</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>Yep, je suis presque d&#8217;accord avec vous, pour les idées <i>basiques</i> <img src='http://s.wordpress.com/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';-)' class='wp-smiley' /> </p>
<p>Tenir mon blog personnel dans un laboratoire universitaire ? Quelle idée saugrenue !</p>
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	</item>
	<item>
		<title>Par : vincent fleury</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-887</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 09:52:09 +0000</pubDate>
		<guid isPermaLink="false">http://coffeeandsci.wordpress.com/?p=430#comment-887</guid>
		<description>vos dénigrements tombent encore à l&#039;eau, si je comprends bien; nous on a fait des manips sur des oeufs ouverts, in vivo. Le papier que vous citez avec votre habituel ton narquois c&#039;est du in vivo aussi. Dans nos manips la pression partielle d&#039;oxygène est-ce qu&#039;elle doit être autour dans l&#039;air de l&#039;incubateur. Le sac vitellin est directement en contact avec l&#039;air, y peut pas être plus oxygéné que ça.
je vous accorde volontiers que l&#039;hypoxie a des tas d&#039;effets sur la vasculogenèse, mais dans notre cas, c&#039;est pas ça.
maintenant quand on place des embryons dans 10% d&#039;oxygène, comme dans le papier que vous citez, évidemment y&#039;a des effets &quot;d&#039;hypoxie&quot; mais aussi des effets indirects d&#039;accélération du battement de coeur, ça me paraît vraiment basique comme idée. Si ça cause des problèmes à l&#039;architecture des yeux, faut penser aussi à cet aspect, avant de dénigrer. Pourquoi vous ne tenez pas ce site dans votre laboratoire, que je puisse intervenir?</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>vos dénigrements tombent encore à l&#8217;eau, si je comprends bien; nous on a fait des manips sur des oeufs ouverts, in vivo. Le papier que vous citez avec votre habituel ton narquois c&#8217;est du in vivo aussi. Dans nos manips la pression partielle d&#8217;oxygène est-ce qu&#8217;elle doit être autour dans l&#8217;air de l&#8217;incubateur. Le sac vitellin est directement en contact avec l&#8217;air, y peut pas être plus oxygéné que ça.<br />
je vous accorde volontiers que l&#8217;hypoxie a des tas d&#8217;effets sur la vasculogenèse, mais dans notre cas, c&#8217;est pas ça.<br />
maintenant quand on place des embryons dans 10% d&#8217;oxygène, comme dans le papier que vous citez, évidemment y&#8217;a des effets &#8220;d&#8217;hypoxie&#8221; mais aussi des effets indirects d&#8217;accélération du battement de coeur, ça me paraît vraiment basique comme idée. Si ça cause des problèmes à l&#8217;architecture des yeux, faut penser aussi à cet aspect, avant de dénigrer. Pourquoi vous ne tenez pas ce site dans votre laboratoire, que je puisse intervenir?</p>
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	<item>
		<title>Par : Oldcola</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-886</link>
		<dc:creator>Oldcola</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 09:28:11 +0000</pubDate>
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		<description>&lt;i&gt;in vitro&lt;/i&gt;, &lt;b&gt;sur des cultures de cellules endothéliales&lt;/b&gt;, pas de battements de coeur, mais altération de l&#039;expression des gènes quand même par l&#039;hypoxie, oui, j&#039;en suis sûr, pas que par la biblio ;-)</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p><i>in vitro</i>, <b>sur des cultures de cellules endothéliales</b>, pas de battements de coeur, mais altération de l&#8217;expression des gènes quand même par l&#8217;hypoxie, oui, j&#8217;en suis sûr, pas que par la biblio <img src='http://s.wordpress.com/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';-)' class='wp-smiley' /> </p>
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	<item>
		<title>Par : vincent fleury</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-885</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 09:24:07 +0000</pubDate>
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		<description>In vitro, l’hypoxie n’induit rien de tel que des battements de coeur accélérés, 

vous êtes sûr? 10% de pression partielle d&#039;Oxygène, ça doit correspondre à 5000m d&#039;altitude. ça ne perturbe pas la fonction cardaque de l&#039;embryon? ça m&#039;étonne. Peut-être.</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>In vitro, l’hypoxie n’induit rien de tel que des battements de coeur accélérés, </p>
<p>vous êtes sûr? 10% de pression partielle d&#8217;Oxygène, ça doit correspondre à 5000m d&#8217;altitude. ça ne perturbe pas la fonction cardaque de l&#8217;embryon? ça m&#8217;étonne. Peut-être.</p>
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	<item>
		<title>Par : Oldcola</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-884</link>
		<dc:creator>Oldcola</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 07:58:08 +0000</pubDate>
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		<description>VF, je n&#039;ai jamais dit que la mécanosensibilité ne joue pas un rôle,  juste qu&#039;elle est génétiquement déterminée ;-)</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>VF, je n&#8217;ai jamais dit que la mécanosensibilité ne joue pas un rôle,  juste qu&#8217;elle est génétiquement déterminée <img src='http://s.wordpress.com/wp-includes/images/smilies/icon_wink.gif' alt=';-)' class='wp-smiley' /> </p>
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	<item>
		<title>Par : vincent fleury</title>
		<link>http://coffeeandsci.wordpress.com/2008/06/08/oxygen-modifies-artery-differentiation-and-network-morphogenesis-in-the-retinal-vasculature/#comment-882</link>
		<dc:creator>vincent fleury</dc:creator>
		<pubDate>Tue, 10 Jun 2008 07:49:09 +0000</pubDate>
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		<description>Vous devriez lire la page de présentation de l&#039;auteur du papier, Toshihiko Ogura:

Introduction of Research 
Orchestration of differentiation, migration and re-assembly of cells is one of the most fundamental aspects of pattern formation of tissues and organs, including central nervous system. We thought that these coordinated behaviors of cells are regulated by a genetic program, in which pivotal genes regulate these steps in a tight and precise manner. This also implies that careful dissection of this genetic program and detailed analyses of functions of genes should help us to understand complicated morphogenesis of tissues and organs. Nonetheless, we have just come to a point to re-evaluate our approaches and to proceed to a new field, which has never been explored.

Pattern formation, such as the Benard convection and the Taylor instability, is also extensively studied in physics and chemistry. In these cases, a homogenous group of molecules can form orderly patterns. In another case, oxidative and reductive states repeat in an oscillatory way, known as the (Belousov-Zhabotinsky) B-Z reaction. These indicate that autonomous mechanisms do exist even in developing embryos, some of which were already studied extensively by Turing and Meinhard.

We have been exploring molecular mechanisms of pattern formation of vertebrate embryos, with central nervous system, limb bud and heart as model organs, and with several key transcription factors as our keen interest. Nonetheless, we have noticed that extensive analyses on the genetic programs are not sufficient for understanding thoroughly the dynamic pattern formation of developing embryos. Recently, we have identified that several proteins change their shapes and conformation in response to physical forces that are generated by cells, hereby such strains trigger next biochemical responses. We are now studying this novel mechanism to understand functional roles of physical forces generated by cells and sensed by cells.

C&#039;es drôle non?</description>
		<content:encoded><![CDATA[<p>Vous devriez lire la page de présentation de l&#8217;auteur du papier, Toshihiko Ogura:</p>
<p>Introduction of Research<br />
Orchestration of differentiation, migration and re-assembly of cells is one of the most fundamental aspects of pattern formation of tissues and organs, including central nervous system. We thought that these coordinated behaviors of cells are regulated by a genetic program, in which pivotal genes regulate these steps in a tight and precise manner. This also implies that careful dissection of this genetic program and detailed analyses of functions of genes should help us to understand complicated morphogenesis of tissues and organs. Nonetheless, we have just come to a point to re-evaluate our approaches and to proceed to a new field, which has never been explored.</p>
<p>Pattern formation, such as the Benard convection and the Taylor instability, is also extensively studied in physics and chemistry. In these cases, a homogenous group of molecules can form orderly patterns. In another case, oxidative and reductive states repeat in an oscillatory way, known as the (Belousov-Zhabotinsky) B-Z reaction. These indicate that autonomous mechanisms do exist even in developing embryos, some of which were already studied extensively by Turing and Meinhard.</p>
<p>We have been exploring molecular mechanisms of pattern formation of vertebrate embryos, with central nervous system, limb bud and heart as model organs, and with several key transcription factors as our keen interest. Nonetheless, we have noticed that extensive analyses on the genetic programs are not sufficient for understanding thoroughly the dynamic pattern formation of developing embryos. Recently, we have identified that several proteins change their shapes and conformation in response to physical forces that are generated by cells, hereby such strains trigger next biochemical responses. We are now studying this novel mechanism to understand functional roles of physical forces generated by cells and sensed by cells.</p>
<p>C&#8217;es drôle non?</p>
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